據介紹，南方聯合產權交易中心以公司制方式組建。鑒于今后一段時間內我省產權市場的交易標的仍主要是企業國有產權的實際，南方聯合產權交易中心在成立之初采取國有控股的股份制公司形式，由省國資委屬下的國有投資公司作為其國有控股股東。具體組建工作，由省國資委負責。

　　南方聯合產權交易中心的資本金由股東投資形成。省國有控股股東的資金由省國資委從省屬國有資產收益中投入，其余股東的資金由廣州、深圳、珠海三市產權交易機構或各地級以上市其他投資機構投入。

　　南方聯合產權交易中心按照《公司法》規范運作，實行董事會領導下的總經理負責制，接受省政府產權市場建設聯席會議及其辦公室的監督管理。省國資委可以委派獨立董事和監事參與南方聯合產權交易中心的法人治理，監督南方聯合產權交易中心及其經營班子合法合規經營。